含氟產品在農藥領域中也廣泛的應用。在過去20年開發的農藥產品中，含氟農藥占到51.9%，尤其殺蟲劑占80%。由于含氟化合物高效，低度，低殘留的特性，將繼續是未來綠色農藥發展的一個主要方向。永太科技的農藥中間體廣泛應用于多種除草劑、殺菌劑，并為全球多家農藥巨頭提供千噸級定制加工服務。
同時，公司通過收購上海濃輝，初步建立了遍及全球60余個國家的農藥中間體、原藥銷售渠道，在海外提交近1800項農藥產品的登記資料，其中獲頒農藥登記證書500余項，已成為擁有海外農藥登記證書最多的國內植保產品出口商之一。